造成變壓器的不對稱運行，就大的方面說有三類原因：
1、由于三相負載不一樣，造成不對稱運行
例如小變壓器供電給照明、電焊等負載，或有的變壓器供電給電氣機車用電及煉鋼爐等具有單相性質的負載等。這種負載不對稱使流過變壓器的三相電流不對稱，由于三相電流不對稱而使三相阻抗壓降不對稱，造成二次側三相電壓不對稱。電壓不對稱，對三相感應電動機和照明設備的運行是不利的。但一般來說，由于變壓器本身阻抗所造成的電壓不對稱程度是不大的。
這種不對稱運行，主要需要考慮的是，在運行中要按Y/Y0-12接線的變壓器的中線電流不超過低壓線圈額定電流的25%。
2、由三臺單相變壓器組成三相變壓器組
當三相變壓器組中一相損壞而用不同參數(如有不同阻抗電壓或不同變比)的一相來代替時，會造成電流和電壓的不對稱。
這種變壓器組，在運行時不僅本組的電流不對稱，還會使其它與之相連的有接地中性線的變壓器會產生地中電流，且其本身的可用容量小于三個單相變壓器容量的總和。可用容量和不對稱程度取決于變壓器參數的配合情況。
3、由于不對稱接線造成變壓器的不對稱運行
這時又可分為下述幾種情況：
(1)兩線一地制：
變壓器仍舊是三相接線，線路中有一相由大地來充當導線叫做兩線一地制，我國農村電網仍有少部分用這種接線方法。
用這種接線法運行，變壓器容量可不降低。只是由于線路和大地的電阻不一樣，使電壓不對稱。但當線路中電壓損失小于10%的情況下，電壓不對稱不超過1%～2%，這是允許的。如果超出這個范圍，只要降低線路輸送功率，就可改善一些。
這種不對稱運行有幾個問題須注意：① 如果未接地相的導線中某一條對地短路時，接地裝置因通過短路電流會產生危險的接觸電壓和跨步電壓，故在進行事故處理時要穿絕緣鞋、戴絕緣手套；② 對鄰近通過的通訊線路能感應出危險的電壓和產生干擾。
(2)變壓器的兩相運行：
在某些情況下需要變壓器兩相運行也造成變壓器的不對稱運行。這些情況如：中性點接地的系統中當一相線路故障，以零線代替該相暫時運行；三相變壓器組中一臺變壓器故障暫以兩相變壓器運行；三相變壓器一相線圈故障暫時以兩相運行等。
這種不對稱運行的共同特點是：變壓器的容量要降低，即可用容量小于仍在運行的兩相變壓器的額定容量之和。可用容量的大小和電流的不對稱程度有關。
造成變壓器兩相運行的原因還有：如變壓器某一側的斷路器某一相斷開和變壓器的分接頭接觸不良等。
變壓器不對稱運行時，對變壓器本身，危害不是太大，因此不需要象發電機那樣對三相不對稱電流的大小做出限制(Y/Y0-12接線的變壓器除外)，主要需要考慮的是因電流電壓的不對稱對用戶的影響，還有對沿線通訊線路的干擾和對電力系統繼電保護工作條件的影響。
