使用特殊容器裝置正己烷，防止泄漏；并遠離火源，且備有滅火設備，防止火災。
容器加蓋防止揮發，不但減少原料損失，且可防止其它員工受害。沾染有機溶劑之抹布亦應置于有蓋容器內。
良好通風設備。
教育訓練：促使員工皆明白正己烷之毒性潛在工作危害，加強危險物有害物之標示與落實物質安全數據表。
衛生習慣：工作場所禁止抽煙、飲食，飯前及下班時要洗手等、可防止火災及食入不必要之有機溶劑。
正己烷勿與丁酮(MBK)共享，防止毒性加成作用。
使用防護設備。
環境監測：勿使空氣中正己烷濃度超過行動值(action level)，即25 ppm。
定期健康檢查：針對神經系統、肝、腎、眼（辨色力）做定期健康檢查。
正己烷是一種很好用的溶劑，在工業上經常與脂肪烴及芳香烴（尤其是甲苯）混合，做溶劑及黏膠。在1960年代末期，日本已有周邊神經病變(peripheral neuropathies)的病例；而美國第一個與正己烷有關的神經毒性疾病在1970年代初才出現。臺灣之印刷業在1983年12月到1985年2月間，爆發了正己烷中毒引起的多發性神經病變。制球業也在1986年發生多發性神經病變，值得注意。
正己烷在高濃度的暴露之下，會造成中樞與周圍神經病變；長期暴露于低濃度(100ppm)的正己烷工作環境，亦會引起不等程度的神經傷害。在工作場所中造成中毒的情形，多半是因為員工不知道正己烷毒性，加上通風不良而工時較長，或者工作人員以廠為家直接睡在工廠內，這些情況都應避免。
吸入正己烷蒸氣會造成上呼吸道的刺激，接觸到正己烷會刺激皮膚與黏膜，食入純正己烷的情形則十分罕見。因為吸入高濃度的正己烷會有欣快感及幻覺的產生，所以吸膠者亦有多發性的神經病變之報告。
正己烷的毒性主要為神經的病變，尤其以周圍神經病變最引人注意，其明顯的病征常使人忽略掉中樞神經病變之可能。
最后應注意的是正己烷經常與各種脂肪烴和甲苯混合使用，因此，除了正己烷本身引起的各種中毒癥狀與病變外，仍應注意其它化合物的毒性。
預防重于治療，利用危害物清單、標示、物質安全數據表、教育訓練及健康檢查等方法，期早期發現妥為防治。
